稻田土壤co氧化细菌coxl基因多样性研究

本实验通过qPCR和构建克隆文库的方法研究了两种免耕稻田不同发生层土壤中固碳细菌coxL基因的数量和多样性。定量PCR结果表明，coxL基因拷贝量随着土壤剖面深度的增大呈现先下降后上升的趋势，耕作层土壤coxL基因拷贝数为4.10~5.79×108 拷贝·每克干土；犁底层为0.42~0.73×108 拷贝·每克干土；渗育层为0.73~1.92×108 拷贝·每克干土。coxL基因系统发育分析表明，Bradyrhizobium为FG和TF两种水稻土中CO氧化细菌的绝对优势类群，在耕作层和犁底层的分布比例最高，占比分别为23.3%~48.1%、24.1%~42.9%，在渗育层的分布有所降低，所占比例为6.7%~15.4%。可以发现，免耕水稻土存在较高数量的CO氧化细菌，Bradyrhizobium在农田土壤碳素循环方面可能具有重要作用。
目录
摘要 1
关键词 1
Abstract 1
Key words 1
1 材料与方法 2
1.1 实验材料 2
1.2 土壤微生物总DNA提取 2
1.3 coxL基因荧光定量标准品制备 3
1.3.1 目的基因扩增 3
1.3.2 目的基因连接质粒 4
1.3.3 质粒提取及拷贝数计算 5
1.4 coxL基因克隆文库的构建 5
1.5 coxL基因克隆文库的分析 6
2 结果与分析 6
2.1 coxL基因的PCR扩增结果 6
2.2 coxL基因在土壤不同剖面层数量分布 7
2.3 coxL基因在不同剖面层的分布的多样性和群落结构分析 8
2.4 coxL基因群落结构、分布及系统发育分析 9
3 讨论 11
致谢 12
参考文献 12
稻田土壤CO氧化细菌coxL基因多样性研究

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