秀丽白虾3个地理种群16srrna基因片段序列差异及系统进化分析

通过对秀丽白虾（Exopalaemon modestus）3个地理种群16SrRNA基因片段进行扩增和测定，得到长度为486bp的片段，其中单倍型I（Hap1）碱基A、T、G、和C的平均含量分别为31.69%、36.63%、20.37%和11.32%，碱基A+T（68.31%）含量明显高于碱基G+C（31.69%）含量。通过对秀丽白虾16SrRNA基因片段遗传特征的研究发现其种内变异较小，在3个地理种群只中有1个位点(第235bp)发生转换。另外利用秀丽白虾486bp的基因片段序列，将其与GenBank中的长臂虾亚科（Palaemoninae）其他相关9个种的16SrRNA序列进行了同源性比对，探讨了系统发育关系。用MEGA3.1软件中的NJ法构建的分子进化树进行系统进化分析，进化树主要分为四大支:第一支是由东方白虾和脊尾白虾先聚在一起后与越南白虾聚成一支，另外还有秀丽白虾的两个单倍型聚在一支，再与以上分支聚在一起，然后和安氏白虾聚成一大支；第二支是由葛氏长臂虾和巨指长臂虾聚成一支，再与锯齿长臂虾聚成一大支；第三支是澳大利亚小长臂虾；第四支是日本沼虾。
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言（或绪论）1
1材料与方法2
1.1实验材料 2
1.2实验方法 2
1.2.1基因组DNA的提取2
1.2.2PCR扩增和产物鉴定2
1.2.3PCR序列测定2
1.2.4数据分析2
2结果与分析3
2.1秀丽白虾16S rRNA基因片段扩增结果3
2.2秀丽白虾16S rRNA基因片段与碱基组成3
2.3基于16S rRNA基因的遗传距离5
2.4基于16S rRNA基因序列的10种长臂虾的系统进化关系5
3讨论6
3.1线粒体DNA 16S rRNA基因序列及其应用6
3.2 16S rRNA序列差异及长臂虾亚科属间系统进化6
3.3有待于进一步研究的问题7
致谢7
参考文献7
图1由引物16SA和16 *好棒文|www.hbsrm.com +Q: #351916072# 
SB扩增出的太湖群体mtDNA的16S rRNA基因片段3
图2秀丽白虾太湖群体单倍型I（Hap1）16S rRNA基因片段核苷酸序列(486 bp)3
图3长臂虾亚科10种虾16S rRNA基因序列的变异位点4
图4长臂虾亚科10种虾16S rRNA基因序列分子进化树6
表1长臂虾亚科10种虾16S rRNA基因片段的碱基组成5
表2用Kimura双参数法计算长臂虾亚科10种虾的遗传距离5
秀丽白虾3个地理种群16SrRNA基因片段序列差异及
系统进化分析

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