不同鲤鱼品种线粒体基因组的pca分析
为了解鲤不同品种之间的亲缘关系和进化关系，以期为今后的鲤选择育种提供参考依据，对能够获得的24条不同品种的鲤完整线粒体基因组序列和根据鲤参考序列，使用33条鲤重测序序列组装得到的线粒体基因组序列，共57条序列进行基础分析、主成分分析（PCA）和系统发育树分析。通过分析，可以知道，除了一些鲤鲫杂交品种，大多数品种的亲缘关系都较近，它们的GC含量基本一致，结合PCA分析和系统发育树，可以清楚看到不同品种之间亲缘关系的远近。
目录
摘要 1
关键词 1
Abstract 1
Key word 1
1 材料与方法 2
1.1 线粒体基因组数据的获得 2
1.1.1 24条鲤线粒体基因组的下载 2
1.1.2 33条线粒体基因组数据的组装 3
1.2 数据的基础分析 4
1.3 主成分分析（Principal Component Analysis,PCA） 4
1.4 系统发育分析 4
2 结果与分析 5
2.1 线粒体基因组的基础分析 5
2.2 主成分分析（PCA） 6
2.3 系统发育树构建 10
3 讨论 11
3.1 不同鲤样品GC含量基本相同 11
3.2 线粒体基因组序列PCA分析 12
3.3 线粒体基因组序列系统发育树分析 12
致谢 12
参考文献 13
不同鲤品种线粒体基因组的PCA分析
目录
摘要 1
关键词 1
Abstract 1
Key word 1
1 材料与方法 2
1.1 线粒体基因组数据的获得 2
1.1.1 24条鲤线粒体基因组的下载 2
1.1.2 33条线粒体基因组数据的组装 3
1.2 数据的基础分析 4
1.3 主成分分析（Principal Component Analysis,PCA） 4
1.4 系统发育分析 4
2 结果与分析 5
2.1 线粒体基因组的基础分析 5
2.2 主成分分析（PCA） 6
2.3 系统发育树构建 10
3 讨论 11
3.1 不同鲤样品GC含量基本相同 11
3.2 线粒体基因组序列PCA分析 12
3.3 线粒体基因组序列系统发育树分析 12
致谢 12
参考文献 13
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