二化螟coⅰ基因的种内分化

本研究利用已有资料的特异性引物,克隆了吉林、安徽、浙江、湖南、湖北和四川6个不同地理种群55头二化螟的线粒体COI基因片段,通过序列比对和遗传距离分析,揭示二化螟不同地理种群间的变异度。结果显示,选用的特异引物可以从二化螟中稳定的克隆出709 bp的基因序列,序列比对和碱基组成分析证实,所克隆的序列片段是二化螟COI基因片段,具有51个变异位点,没有缺失和插入现象。利用进化树分析发现不同地理种群没有明显的独立聚类,种群间的遗传距离为0.006~0.012,与种群内个体间的遗传距离相当(0 ~0.02)。讨论认为,所克隆的二化螟COI基因片段具有适宜的变异信息,不同地理种群之间虽有一定分化,但遗传变异较小。
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words 1
1材料与方法2
1.1试虫 2
1.2主要试剂 2
1.3主要仪器设备2
1.4总DNA的提取2
1.5 PCR3
1.5.1 PCR引物3
1.5.2 PCR反应3
1.5. 3 PCR产物的回收和纯化3
1.5.4 连接反应3
1.5.5 连接产物的转化3
1.5.6重组质粒检测4
1.5.7测序及序列分析4
2结果与分析4
2.1二化螟COⅠ基因的克隆4
2.2二化螟COⅠ基因序列组成和变异5
2.3二化螟COⅠ基因的碱基差异分析6
2.4二化螟COⅠ基因的遗传距离6
2.5二化螟不同地理种群的系统发育树6
3讨论 8
致谢8
参考文献8
图1克隆获得的二化螟线粒体COI基因片段5
图2 邻接法构建的二化螟不同种群的系统发育树7
表1 二化螟的COI基因碱基变异位点5
表2 不同地理种群二化螟的COI基因碱基替换模式6
表3 二化螟6个地理种群之间的遗传距离6 二化螟COⅠ基因的种内分化

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