湖羊卵巢组织中NR5A2基因表达水平与繁殖性能的关系
湖羊卵巢组织中NR5A2基因表达水平与繁殖性能的关系[20200510204306]
摘要:根据黄牛NR5A2基因序列设计引物,通过PCR扩增和克隆测序获得湖羊NR5A2基因编码区序列结构以及与其他物种的系统发育关系,并且对湖羊进行了NR5A2基因的组织表达谱和卵巢组织中NR5A2基因的表达量进行了分析,最后对湖羊NR5A2基因的编码区进行了多态性分析。结果表明:湖羊NR5A2基因编码区序列长度为1488bp,共编码495个氨基酸,含有两个功能结构域,且与牛和人的蛋白结构域一致。系统发育分析显示湖羊和牦牛首先聚为一类,后与马相聚;人、黑猩猩和狨毛猴聚为一类,而与鱼类相聚较远,与经典分类基本一致。组织表达谱分析NR5A2基因在各个组织均有表达,其中在卵巢高表达。卵巢组织NR5A2基因表达水平分析与排卵数间呈极显著正相关(P<0.01),相关系数为0.8125;NR5A2基因表达水平与第一胎产羔数间、第二胎产羔数间和平均产羔数间均呈显著正相关(P<0.05),相关系数分别为0.7092,0.6496,0.7562。结论:NR5A2基因与湖羊的排卵数和产羔数呈极显著或显著正相关,可作为湖羊高产的候选基因,NR5A2基因在湖羊群体中的多态性还有待进一步研究。在NR5A2基因编码区设计引物测序分析发现有T1419C和A1449G的单碱基突变但没有引起编码氨基酸的改变。
*好棒文|www.hbsrm.com +Q: ¥351916072¥
关键字:湖羊;NR5A2;序列分析;繁殖性能;SNP
目录
摘要 1
关键词 1
Abstract 1
Key words 2
引言 2
1 材料与方法 2
1.1试验动物 2
1.2 组织总RNA提取与反转录 2
1.3 引物合成 2
1.4 湖羊NR5A2基因 cDNA 序列的 RT-PCR 扩增、克隆测序与组织表达谱 3
1.5 序列分析与系统发育树的构建 3
1.6 Real-time 定量 PCR 4
1.7 数据分析 4
2 结果与分析 4
2.1 湖羊NR5A2 基因的扩增和序列分析 4
2.2 哺乳动物NR5A2基因进化与系统发育树分析 7
2.3 湖羊NR5A2 基因的组织表达谱分析 7
2.4 湖羊卵巢组织NR5A2基因mRNA表达水平与排卵数、产羔数相关分析 8
2.5 湖羊NR5A2基因编码区SNPs筛选 9
3 讨论 10
致谢 10
参考文献 11
湖羊卵巢组织中NR5A2基因表达水平与繁殖性能的关系
摘要:根据黄牛NR5A2基因序列设计引物,通过PCR扩增和克隆测序获得湖羊NR5A2基因编码区序列结构以及与其他物种的系统发育关系,并且对湖羊进行了NR5A2基因的组织表达谱和卵巢组织中NR5A2基因的表达量进行了分析,最后对湖羊NR5A2基因的编码区进行了多态性分析。结果表明:湖羊NR5A2基因编码区序列长度为1488bp,共编码495个氨基酸,含有两个功能结构域,且与牛和人的蛋白结构域一致。系统发育分析显示湖羊和牦牛首先聚为一类,后与马相聚;人、黑猩猩和狨毛猴聚为一类,而与鱼类相聚较远,与经典分类基本一致。组织表达谱分析NR5A2基因在各个组织均有表达,其中在卵巢高表达。卵巢组织NR5A2基因表达水平分析与排卵数间呈极显著正相关(P<0.01),相关系数为0.8125;NR5A2基因表达水平与第一胎产羔数间、第二胎产羔数间和平均产羔数间均呈显著正相关(P<0.05),相关系数分别为0.7092,0.6496,0.7562。结论:NR5A2基因与湖羊的排卵数和产羔数呈极显著或显著正相关,可作为湖羊高产的候选基因,NR5A2基因在湖羊群体中的多态性还有待进一步研究。在NR5A2基因编码区设计引物测序分析发现有T1419C和A1449G的单碱基突变但没有引起编码氨基酸的改变。
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关键字:湖羊;NR5A2;序列分析;繁殖性能;SNP
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摘要 1
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Key words 2
引言 2
1 材料与方法 2
1.1试验动物 2
1.2 组织总RNA提取与反转录 2
1.3 引物合成 2
1.4 湖羊NR5A2基因 cDNA 序列的 RT-PCR 扩增、克隆测序与组织表达谱 3
1.5 序列分析与系统发育树的构建 3
1.6 Real-time 定量 PCR 4
1.7 数据分析 4
2 结果与分析 4
2.1 湖羊NR5A2 基因的扩增和序列分析 4
2.2 哺乳动物NR5A2基因进化与系统发育树分析 7
2.3 湖羊NR5A2 基因的组织表达谱分析 7
2.4 湖羊卵巢组织NR5A2基因mRNA表达水平与排卵数、产羔数相关分析 8
2.5 湖羊NR5A2基因编码区SNPs筛选 9
3 讨论 10
致谢 10
参考文献 11
湖羊卵巢组织中NR5A2基因表达水平与繁殖性能的关系
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