畜禽基因组中重复序列的研究

重复序列是家畜基因组的重要组成部分，并在基因组中占据的比例很高。随着现代分子生物学技术的进步，畜禽基因组中的重复序列被不断被探索和挖掘。本试验检测了反刍动物（牛、羊）、猪和鸡的基因组中L1、RTE和CR1的含量及其在各染色体上的长度。其中，L1序列在牛的基因组中的平均含量为7.82%，平均长度为517bp；在羊的基因组中平均含量为7.81%，平均长度489bp；猪的基因组中平均含量为9.69%，平均长度581bp；RTE在牛的基因组中平均含量为11.46%。平均长度为454bp；在羊的基因组中平均含量为11.43%，平均长度为515bp；猪基因组中不含RTE。且L1和RTE的含量和染色体GC含量之间的关系呈负相关。鸡的基因组中不含L1和RTE，而含有大量CR1，在基因组中的平均含量为1.87%，平均长度为575bp。重复序列不仅仅作为基因组序列的组成部分，同时影响着染色体的高级结构，其周围基因的表达，同时也推动基因组的进化。本研究结果对后续辅助畜禽重要性状的候选基因定位及家畜家禽品种起源分化的探索工作提供有用的参考信息。
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1 材料与方法3
1.1 实验材料 3
1.1.1 基因组序列来源3
1.1.2 长散布元件模板序列来源3
1.1.3 主要分子生物学软件3
1.2 研究方法 3
1.2.1 L1、RTE和CR1在基因组中含量的分析方法3
2 结果与分析3
2.1 牛、羊和猪基因组中L1含量分析4
2.1.1 L1在牛基因组中的分布4
2.1.2 L1在羊基因组中的分布4
2.1.3 L1在猪基因组中的分布5
2.2 牛、羊、猪和鸡基因中RTE的分析6
2.3 鸡基因组中CR1的分析8
3 讨论 9
4 结论 10
致谢10
参考文献10
畜禽基因组中重复序列的研究

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