5株猪圆环病毒2型毒株全基因组的克隆与序列分析

为研究江苏地区猪圆环病毒2型（PCV2）基因组特征与当前流行的PCV2基因亚型，本试验对2015年在江苏采集的122份病料进行PCR检测，并从中随机选取5份PCV2阳性病料进行全基因组克隆和序列分析。结果显示，5株PCV2中有1株全基因组大小为1768 bp，其余均为1767 bp，同源性为95.1%-99.6%，与国内外7株参考株同源性为94.2%-98.7%；其ORF2序列与GenBank登陆的一些具有代表性的PCV2参考序列同源性为87.2%-99.9%；系统进化树结果显示，5株PCV2有3株归属于PCV2b，其他两株分别归属于PCV2d（mPCV2b）和PCV2c分支。本次试验的研究结果为掌握江苏猪群中PCV2地方流行毒株提供科学依据，为猪圆环病毒的防控奠定理论基础。
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1材料与方法2
1.1材料 2
1.1.1待检样品 2
1.1.2试剂及培养基2
1.1.3主要仪器 2
1.1.4引物 2
1.1.5分子生物学软件2
1.2实验方法 2
1.2.1 DNA提取及样品PCR检测2
1.2.2 PCV全基因组的克隆扩增2
1.2.3回收目的片段3
1.2.4构建重组质粒3
1.2.5转化 3
1.2.6菌液PCR 3
1.2.7测序结果比对分析3
2 结果3
2.1 样品检测结果3
2.2 PCV2全长扩增4
2.3 菌液PCR结果4
2.4 序列分析5
2.4.1 PCV2全基因组同源性分析5
2.4.2基于ORF2的同源性比较和遗传变异的分析6
3 结论与讨论 7
致谢8
参考文献8
附录A LB培养基9
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