2015年猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析
:猪流行性腹泻病是由冠状病毒——猪流行性腹泻病毒(PEDV)引起,对哺乳仔猪危害极大。为了分析猪流行性腹泻病毒的遗传变异情况,本试验从江苏省六个城市的不同地区发生仔猪腹泻疾病的猪场采集的病料中选取了8个PEDV阳性样品,扩增了其S基因和ORF3基因序列,并进行了同源性比对和遗传进化分析。结果显示8个样品中的JSSQ1502、JSTC1505、JSRD1505、JSSQ1509和标准毒株CV777的亲缘关系比较密切,其它4个样本和比对的几个标准毒株亲缘关系都较远。本试验结果可以提示部分PEDV在近年呈现变异和进化的趋势,因而可能需要选择更有效的疫苗株来控制我国PEDV的发病情况,对此仍需进行PEDV遗传变异情况的进一步研究。
目录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言3
1.材料与方法4
1.1试验器材4
1.1.1样品4
1.1.2主要仪器4
1.1.3主要试剂4
1.2试验方法4
1.2.1病料的采集和处理5
1.2.2提取病毒RNA5
1.2.3反转录5
1.2.4 PCR条件的优化5
1.2.5 PCR扩增和电泳6
1.2.6 DNA片段回收6
1.2.7克隆6
1.2.8测序及分析7
2.结果与分析7
2.1样品检测的结果7
2.2 PCR条件优化的结果7
2.3 PCR扩增的结果7
2.4 基因序列同源性分析7
2.4.1 S基因序列的同源性分析7
2.4.2 ORF3基因序列的同源性分析8
2.5基因遗传进化分析8
2.5.1 S基因的遗传进化分析8
2.5.2 ORF3基因的遗传进化分析8
3.讨论9
致 谢 10
参考文献 10
2015年江苏省猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析
目录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言3
1.材料与方法4
1.1试验器材4
1.1.1样品4
1.1.2主要仪器4
1.1.3主要试剂4
1.2试验方法4
1.2.1病料的采集和处理5
1.2.2提取病毒RNA5
1.2.3反转录5
1.2.4 PCR条件的优化5
1.2.5 PCR扩增和电泳6
1.2.6 DNA片段回收6
1.2.7克隆6
1.2.8测序及分析7
2.结果与分析7
2.1样品检测的结果7
2.2 PCR条件优化的结果7
2.3 PCR扩增的结果7
2.4 基因序列同源性分析7
2.4.1 S基因序列的同源性分析7
2.4.2 ORF3基因序列的同源性分析8
2.5基因遗传进化分析8
2.5.1 S基因的遗传进化分析8
2.5.2 ORF3基因的遗传进化分析8
3.讨论9
致 谢 10
参考文献 10
2015年江苏省猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析
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