H3N2亚型犬流感病毒南京分离株的鉴定及遗传演化分析
H3N2亚型犬流感病毒南京分离株的鉴定及遗传演化分析[20200507190426]
摘要：为了解南京地区犬流感病毒的亚型，采集6只具有呼吸道症状犬的鼻咽拭子，接种SPF鸡胚分离病毒，结果，获得1株犬流感病毒。经RT-PCR扩增、片段回收、连接载体、转化获得分离株的基因组cDNA序列，并对其进行亚型鉴定和序列分析。序列分析显示，分离株的血凝素HA、神经氨酸NA基因与参考毒株的基因序列的相似性为93 %-99 %，其中与犬流感病毒中国分离株同源性最高，在98 %以上。基因序列比对发现，HA 氨基酸存在4处独特突变：A144T、R158K、D291N、L383F；NA 氨基酸存在4处独特突变：T19A、V33L、V82A、S336N。遗传演化分析显示，此株病毒与近年来从犬犬流感病毒中国分离株亲缘关系均较近，位于同一进化分支。
*好棒文|www.hbsrm.com +Q: ^351916072*
关键字:犬流感病毒；H3N2亚型；分离鉴定；遗传演化
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1 材料与方法2
1.1 材料 2
1.2.1 样品来源 2
1.2.2 SPF鸡胚2
1.2.3 试剂2
1.2 方法2
1.2.1 设计引物序列2
1.2.2 病毒分离 2
1.2.3 病毒RNA 的提取2
1.2.4 RT-PCR 的扩增2
1.2.5 HA 和NA 基因的克隆与鉴定2
2 结果 3
2.1 病毒的分离与鉴定3
2.2 HA 和NA 基因的检测3
2.3 分子序列同源性与系统进化分析4
2.3.1 HA 基因序列分析4
2.3.2 NA 基因序列分析 4
2.4 基因编码区变异性分析6
2.4.1 HA 基因编码区变异性分析7
2.4.2 NA 基因编码区变异性分析 7
3 讨论7
致谢8
参考文献8
H3N2亚型犬流感病毒南京分离株的鉴定
及遗传演化分析
摘要：为了解南京地区犬流感病毒的亚型，采集6只具有呼吸道症状犬的鼻咽拭子，接种SPF鸡胚分离病毒，结果，获得1株犬流感病毒。经RT-PCR扩增、片段回收、连接载体、转化获得分离株的基因组cDNA序列，并对其进行亚型鉴定和序列分析。序列分析显示，分离株的血凝素HA、神经氨酸NA基因与参考毒株的基因序列的相似性为93 %-99 %，其中与犬流感病毒中国分离株同源性最高，在98 %以上。基因序列比对发现，HA 氨基酸存在4处独特突变：A144T、R158K、D291N、L383F；NA 氨基酸存在4处独特突变：T19A、V33L、V82A、S336N。遗传演化分析显示，此株病毒与近年来从犬犬流感病毒中国分离株亲缘关系均较近，位于同一进化分支。
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关键字:犬流感病毒；H3N2亚型；分离鉴定；遗传演化
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1 材料与方法2
1.1 材料 2
1.2.1 样品来源 2
1.2.2 SPF鸡胚2
1.2.3 试剂2
1.2 方法2
1.2.1 设计引物序列2
1.2.2 病毒分离 2
1.2.3 病毒RNA 的提取2
1.2.4 RT-PCR 的扩增2
1.2.5 HA 和NA 基因的克隆与鉴定2
2 结果 3
2.1 病毒的分离与鉴定3
2.2 HA 和NA 基因的检测3
2.3 分子序列同源性与系统进化分析4
2.3.1 HA 基因序列分析4
2.3.2 NA 基因序列分析 4
2.4 基因编码区变异性分析6
2.4.1 HA 基因编码区变异性分析7
2.4.2 NA 基因编码区变异性分析 7
3 讨论7
致谢8
参考文献8
H3N2亚型犬流感病毒南京分离株的鉴定
及遗传演化分析
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