猪圆环病毒3型全基因组扩增与序列分析

PCV3是一种新型致病性猪圆环病毒,能引起猪皮炎肾病综合征、母猪繁殖障碍等多种临床疾病,给养猪业造成巨大的经济损失。本文建立了PCV3全基因组扩增的PCR方法,通过梯度PCR确定最佳反应条件。对PCV3阳性样品进行全基因组序列扩增,扩增产物测序后拼接得到4个病毒株的全基因序列。与Genebank中31个已有PCV3全长序列进行比对及遗传变异分析,PCV3 1798和PCV3 1799的同源性为99.8%,PCV3 1513与PCV3 1344,PCV3 1798,PCV3 1799的同源性分别为98.9%,98.8%,98.8%。PCV3全基因组扩增方法的建立便于今后PCV3毒株的分离,为进一步研究提供依据。
目录
摘要 1
关键词 1
Abstract 1
Key words 1
引言 1
1 实验材料: 2
1.1 病料 2
1.2 主要试剂 2
1.3实验仪器 2
2 实验方法 3
2.1 病毒基因组的抽提 3
2.2 引物设计与合成 3
2.3 阳性病料的筛选 3
2.4 PCR反应条件的优化 3
2.5 PCV3 F1片段扩增 3
2.6 PCV3 F2片段扩增 3
2.7 目的片段TA克隆 3
2.8 全基因测序及分析 4
3 实验结果 4
3.1 阳性病料筛选结果 4
3.2 最佳反应条件 4
3.3 全基因组扩增 5
3.4 目的片段TA克隆 6
3.5 全基因组测序及分析 6
4 讨论 7
致谢 8
参考文献 9
附录1 阳性病料表 10
附录2 4株 PCV3 全基因序列 11 猪圆环病毒3型全基因组扩增与序列分析

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好棒文